Le site de plongée de Siaba Besar est pour la plupart peu profond, protégé des courants de Komodo. Il est composé d'un fond sableux, de magnifiques jardins de coraux durs et d'une pente douce menant à un canal. C'est le site de plongée parfait pour les plongeurs débutants, les amoureux des tortues et pour ceux qui apprécient une plongée facile et relaxante mais néanmoins magnifique.

Siaba Kecil est situé dans la zone centrale du parc national de Komodo. La topographie se compose de surplombs et d'un jardin de corail. C'est un site de plongée de niveau avancé car les conditions actuelles sont modérées à fortes. Le point culminant de ce site de plongée est le corail mou et le corail dur. La profondeur maximale est de 30 mètres.

La Pengah est située dans la zone centrale du parc national de Komodo. La topographie ici comprend un pinacle et un plateau. C'est un site de plongée convivial pour les débutants car le courant y est léger à modéré. La profondeur maximale est de 30 m.

A Mawan ("belle" dans la langue locale), il y a des stations de nettoyage de manta. Ce site est situé dans la partie centrale du parc national de Komodo. La topographie consiste en une pente de sable blanc avec jardin de corail et récif frangeant. C'est un site de plongée adapté aux débutants. La profondeur maximale est de 30 m.

Tatawa Kecil est situé au centre du parc national de Komodo. Le point culminant de ce site de plongée est le jardin de corail mou et de corail dur. La profondeur maximale est de 30 mètres. Ce site convient aux plongeurs expérimentés car les conditions actuelles peuvent être fortes.

Tatawa Besar est situé dans la zone centrale du parc national de Komodo. La topographie est celle d'un récif en pente et constitue un site adapté à tous les niveaux de plongeurs. Le courant peut être léger à modéré, offrant une plongée dérivante facile. La profondeur maximale est de 30 mètres.

Le plus célèbre "Trou dans le rocher" (de la traduction indonésienne), Batu Bolong est populaire pour accueillir la plus grande variété de vie marine et de corail, mais aussi pour être au cœur de la "Ville des courants".

Gindang est un site de plongée près de l'île de Rinca, où l'on trouve une grande macro vie autour des fonds sableux. C'est une alternative à Wainilu et peut être un paradis pour les amateurs de macrophotographie. Situé dans la zone centrale, c'est un site convivial pour les débutants.

Sebayur est situé dans la zone centrale du parc national de Komodo. La topographie est une zone de fond sableuse et en pente. Un site de plongée convivial pour les débutants car les conditions actuelles sont faciles. Les points forts du site de plongée sont les coraux mous et durs, et les anguilles de jardin. La profondeur maximale est de 30 mètres.

Karang Makassar, ou Manta Point comme il est plus connu, est le plus grand site de plongée du parc national de Komodo, avec environ 3 km de long sur 400-500 m de large. C'est un site de plongée en dérive peu profond, avec un magnifique récif corallien au sud, des dunes au nord et un fond de corail en décombres entre les deux, parsemé de stations de nettoyage de manta.