Il s'agit d'une petite île située à l'est de l'île d'Iriomote, d'une circonférence d'environ 16 km. Il y a un hôtel de villégiature de luxe sur l'île. Entre cette île et l'île d'Iriomote se trouve la voie navigable Yonara. Il y a environ 400 sortes de coraux colorés comme le corail de table et le corail eda autour de l'île, et les poissons tropicaux sont très beaux. Il y a plusieurs points dans la voie navigable de Yonara où vous pouvez rencontrer des raies manta.

Kuroshima est situé dans la partie sud-ouest de l'île d'Ishigaki. Il faut environ 30 minutes en bateau pour rejoindre l'île d'Ishigaki. La profondeur de l'eau est d'environ 17 mètres. Il n'y a pas de courant et c'est amusant pour les débutants. La partie principale du site est une racine où se trouve un banc de poissons de récif à flanc jaune et la densité des ombres de poissons est écrasante. De nombreux poissons carnivores, dont de gros mérous, se sont rassemblés pour en profiter. On peut également voir des anguilles de jardin dans les zones sableuses le long du chemin.

Le canal de Yonara passe entre l'île d'Iriomote et l'île de Kohama, qui est longue de 6 km et large de 500 à 900 m environ. Le courant est constant et parfois très fort. Il s'agit toujours d'une plongée dérivante à des profondeurs de 9 à 30 mètres.

Ce site de plongée, situé au nord-ouest de l'île d'Ishigaki, a l'un des taux les plus élevés au monde de rencontres avec des raies manta. Il peut être atteint par bateau en 10 à 15 minutes. La profondeur de l'eau est d'environ 10 à 20 m et la marée est relativement calme mais peut parfois devenir plus forte. Une petite colline au milieu de la mer est une station de nettoyage où les raies manta viennent en visite. Les raies manta nagent à une profondeur de 5 à 10 mètres, vous pouvez donc les voir en faisant de la plongée libre.

Le récif de Yonehara se trouve à la pointe de Kawadaira, dans la partie nord de l'île d'Ishigaki. Ce site est une entrée de bateau uniquement. La profondeur moyenne est de 5 à 30 mètres. Il y a un plateau de corail à 5 à 6 mètres de profondeur qui tombe dans une zone sableuse dans 20 à 25 mètres d'eau avec trois racines, densément peuplée de coraux de table et de tourbillons.

L'île d'Iriomote est également connue sous le nom de "Galapagos de l'Est". Environ 90 % de l'île est couverte d'une forêt vierge. On y trouve des montagnes de 300 à 400 m de haut, plus de 40 rivières et de nombreuses chutes d'eau. Par conséquent, les gens viennent ici non seulement pour la plongée, mais aussi pour profiter de la nature de l'île.

L'île d'Hateruma est située au sud de l'île d'Iriomote. Vous pouvez vous y rendre en ferry depuis l'île d'Ishigaki, mais vous pouvez également vous y rendre depuis l'île d'Iriomote pour y faire de la plongée. Il n'y a pas de bus ni de signaux sur l'île. Toutes les plongées se font en bateau. L'attrait d'Hateruma est sa grande clarté, dépassant parfois les 50 mètres, et vous pouvez profiter de la belle mer bleue qui coule dans le sable blanc pur. Il y a de nombreux points de sable sur la côte nord-ouest et des points de débarquement et de grands poissons migrateurs sur la côte est.

Il y a une île inhabitée à environ 15 km au sud-ouest de l'extrémité sud de l'île Iriomote, qui s'appelle Ogan. A environ 1 heure de bateau de l'île d'Iriomote. La célèbre "Racine orientale" est un terrain dynamique avec d'énormes racines cachées qui s'élèvent du fond de la mer à une profondeur de 40 mètres. C'est un endroit avancé en raison du courant rapide.

Les ruines sous-marines ont été découvertes par un plongeur local en 1986 et constituent un lieu de plongée populaire à Yonaguni, au même titre que les requins marteaux. Il est situé à environ 15 minutes du port. Un énorme mur en forme d'escalier s'étend sur environ 250 m d'est en ouest et 150 m du nord au sud pour former les ruines.

L'île la plus occidentale du Japon. Elle est plus proche de Taïwan que l'île d'Ishigaki. Il faut environ 45 minutes pour se rendre de l'île d'Ishigaki en avion. Le point fort de cette île est la forte probabilité de voir des requins marteaux. Parmi eux, c'est le point où les rochers, comme des bâtiments, se dressent verticalement du fond de la mer à une profondeur de 35 mètres.