Batu Tiga está localizado na área central do Parque Nacional de Komodo. Este é um local de mergulho de nível avançado, pois geralmente há uma forte corrente. Os destaques do mergulho incluem excelente habitat para peixes grandes como napoleon wrasse, garoupa, trevally gigante, e barracuda . A profundidade máxima é de 35 metros.

As Três Irmãs são três grandes rochas todas ligadas entre si, todas cobertas com corais, esponjas azuis, e estão cheias de vida. Você vai mergulhar na sombra da corrente e terminar o mergulho nos picos que se situam respectivamente a 6, 7 e 8 metros. Você pode ter a sorte de ver raios cruzando no topo dos pináculos.

O Pillarsteen ostenta paredes dramáticas, deslumbrantes nados, e enormes corais de chicote. Este local de mergulho não tem abrigo contra a ondulação do Oceano Índico, portanto, espere que haja uma onda. Quando a ondulação está calma, é possível avistar fantásticas macro-criaturas desde maçãs do mar até ao chicote de corais camarões parceiros.

O Jardim Secreto oferece um grande cenário tanto para os macro entusiastas como para aqueles que procuram espécies maiores. Com um arrecife suavemente inclinado, no raso este local ostenta uma rica variedade de corais-bomba, mais os corais macios servem de anfitrião para enormes cardumes de peixes de recife.

Karang Makassar, ou Manta Point, como é mais conhecido, é o maior local de mergulho do Komodo National Park, com aproximadamente 3 km de comprimento por 400-500m de largura. É um local de mergulho pouco profundo com um belo recife de coral ao sul, dunas ao norte e um fundo de coral de entulho no meio, espalhado com estações de limpeza de manta.

Makassar Reef, também conhecido como Manta Point, está localizado na área central do Parque Nacional de Komodo. Tem um fundo de escombros e é um local de mergulho amigável para iniciantes. A profundidade máxima é de 18 m. Este local é considerado um local de mergulho à deriva.

A viela Manta está localizada na área sul do Parque Nacional de Komodo. A topografia é inclinada, com uma composição inferior de recife de coral, vegetação e rocha. Este local de mergulho é adequado para todos os níveis de mergulhadores. Há uma grande possibilidade de grandes condições de ondas. A profundidade máxima é de 40 metros.

O mais famoso "Hole in the Rock" (da tradução Indonésia),Batu Bolong é popular por abrigar a maior variedade de vida marinha e corais, mas também por estar no coração da "Cidade Atual".

Em Mawan ("bela" na língua local) existem estações de limpeza de manta. Este local está localizado na parte central do Parque Nacional Komodo. A topografia é constituída por uma encosta de areia branca com jardim de coral e recife de coral. Este é um local de mergulho para principiantes. A profundidade máxima é de 30 m.

A Golden Passage está localizada na área norte do Parque Nacional Komodo. É um local inclinado com uma profundidade máxima de 25 metros. Um local adequado para mergulhadores experientes, uma vez que as condições actuais são geralmente fortes.