Esta é uma pequena ilha no leste da Ilha de Iriomote, cerca de 16 km em circunferência. Há um hotel resort de luxo na ilha. Entre esta ilha e Iriomote Island fica a Yonara Waterway. Há cerca de 400 tipos de corais coloridos, como o coral de mesa e o coral eda ao redor da ilha, e os peixes tropicais são muito bonitos. Existem vários pontos na Yonara Waterway onde você pode encontrar as arraias manta.

Este local está localizado no lado norte da Ilha Taketomi, a cerca de 15 minutos de barco da Ilha Ishigaki. Há vários buracos onde as bolhas saem da areia em forma de argamassa a uma profundidade de 20 metros. Este é um local único onde jorram águas termais de nascentes.

O Canal Yonara passa entre a Ilha Iriomote e a Ilha Kohama, que tem 6km de comprimento e cerca de 500 a 900m de largura. A corrente é constante e, por vezes, muito forte. Este é sempre um mergulho à deriva em profundidades de 9 a 30 metros.

A Ilha de Iriomote é também conhecida como "Galápagos do Oriente". Cerca de 90 por cento da ilha é coberta por uma floresta primitiva. Há montanhas de 300 a 400 m de altura, mais de 40 rios e muitas quedas de água. Portanto, as pessoas vêm aqui não só para mergulhar, mas também para desfrutar da natureza da ilha.

Este local de mergulho, localizado no lado noroeste da Ilha de Ishigaki, tem uma das mais altas taxas de encontros com as radiações manta do mundo. Pode ser alcançado por barco em 10 a 15 minutos. A profundidade da água é de cerca de 10-20m e a maré é relativamente calma, mas pode se tornar mais forte às vezes. Uma pequena colina no meio do mar é uma estação de limpeza onde as radiações manta vêm para visitar. As radiações manta nadam a uma profundidade de 5 a 10 metros, para que você possa vê-las com snorkeling.

Yonehara Reef é encontrado no ponto em Kawadaira, na parte norte da ilha de Ishigaki. Este local é apenas uma entrada de barco. A profundidade média é de 5 a 30 metros. Há uma plataforma de corais a 5 a 6 metros de profundidade que cai em uma área arenosa em 20 a 25 metros de água com três raízes, densamente povoada com corais de mesa e de Foucault.

A Ilha Hateruma fica a sul da Ilha Iriomote. Você pode ir até lá de balsa da Ilha Ishigaki, mas também pode chegar lá da Ilha Iriomote para mergulhar. Não há autocarros ou sinais na ilha. Todos os mergulhos são de barco. O atrativo de Hateruma é sua alta claridade, às vezes superior a 50 metros, e você pode desfrutar do belo mar azul que flui através da areia branca pura. Há muitos pontos de areia na costa noroeste e pontos de largada e grandes peixes migratórios na costa leste.

Existe uma ilha desabitada a cerca de 15 km a sudoeste do extremo sul da Ilha de Iriomote, que se chama Ogan. A cerca de 1 hora de barco da Ilha de Iriomote. O famoso "Eastern Root" é um terreno dinâmico com enormes raízes escondidas que se erguem do fundo do mar a uma profundidade de 40 metros. Este é um ponto avançado devido à corrente rápida.

As Ruínas Subaquáticas foram descobertas por um mergulhador local em 1986 e é um local de mergulho popular em Yonaguni, juntamente com tubarões-martelo. Fica a cerca de 15 minutos do porto. Uma enorme parede em forma de escada estende-se por cerca de 250m este-oeste e 150m norte-sul para formar as ruínas.

A ilha mais ocidental do Japão. É mais perto de Taiwan do que a ilha de Ishigaki. Leva cerca de 45 minutos da Ilha Ishigaki para chegar de avião. O ponto alto desta ilha é a grande chance de ver tubarões-martelo. Entre eles, este é o ponto onde as rochas, como edifícios, ficam verticalmente do fundo do mar a uma profundidade de 35 metros.